Midt i neonlyset er menneskene ved at glimmer ved at slugt op kommercielle bekvemmeligheder forårsaget af tekniske fremskridt. I skyggerne er en krig imellem Yatagaratsu og Phantom Society under opsejling, og Devil Summoners, der besidder overjordiske kræfter fra "Dæmoner".
En digital tænketank i det hemmelige hav af menneskehedens data har udviklet sig til sansning: Aion. Aion betragter menneskeheden på afstand og regner ud, at en dommedagskatastrofe er nær og skaber to agenter, der skal bekæmpe det: Ringo og Figue.
Sammen skal disse agenter fra Aion efterforske og forhindre en sommerfugleeffekt, der vil ende i dommedag.