Isaac Clarke är en helt vanlig ingenjör som fått i uppdrag att reparera det stora planetbrytarskeppet USG Ishimura, men väl på plats upptäcker han att någonting har gått fruktansvärt fel. Besättningen har slaktats och Isaacs partner Nicole är försvunnen ombord på skeppet.
Nu börjar en desperat kamp mot klockan för ta reda på vad som orsakat mardrömmen ombord på Ishimura och hitta Nicole, och allt Isaac har att tillgå är sina verktyg och ingenjörskunskaper. Men han är inte helt ensam – skeppet hemsöks nämligen av blodtörstiga nekrofmorfer. Ska Isaac klara sig mot fasorna måste han hålla huvudet kallt och inte tappa förståndet.