Η ψυχωτική AI SHODAN έχει πάρει τον έλεγχο του Citadel Station και έχει μετατρέψει το πλήρωμά του σε σάιμποργκ και μεταλλαγμένους.
Πρέπει να αναμετρηθείτε με αυτούς τους εχθρούς και να σταματήσετε τη SHODAN πριν κάνει στη Γη ό,τι έκανε στον διαστημικό σταθμό και καταφέρει να σπείρει τον όλεθρο.
Σταματήστε τη SHODAN και αποτρέψτε την καταστροφή της ανθρωπότητας. Η πτώση της είναι η σωτηρία μας.