Vaarallisen okkultistin johtamat yliluonnolliset joukot valtaavat Tokion, mikä saa kaupungin asukkaat katoamaan silmänräpäyksessä.
Kohtaa tuntematon ja selvitä synkkä totuus väestön salaperäisestä katoamisesta liittoutumalla kostoretkellä olevan voimakkaan yliluonnollisen olennon kanssa ja hallitse monipuolinen kykyarsenaali Ghostwire: Tokyo -pelissä.