1998年に発売されたシリーズ第2作『スターオーシャン セカンドストーリー』が『STAR OCEAN THE SECOND STORY R』としてリメイクで登場。2Dピクセルのキャラクターと3Dのフィールドが見事に融合している作品となっている。
いつもの調査任務中、連邦の青年将校クロード・C・ケニーは見知らぬ惑星に飛ばされた。クロードはそこで出会った少女に伝説の勇者であると勘違いされてしまう。
美しいビジュアルの刷新に加えて、『STAR OCEAN THE SECOND STORY R』では新しい戦闘システム、イベントフルボイス収録、作曲家「桜庭 統」氏によるオリジナルのBGMとアレンジ版、ファストトラベルなどの機能改善も実装。往年のファンはもちろん、初心者でも楽しめる決定版となっている。
